| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
|
Data corrente: |
18/11/2011 |
|
Data da última atualização: |
18/11/2011 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
ANDRADE, F. T.; CAIXETA, E. T.; MACIEL, B. H.; ALVARENGA, S. M.; ZAMBOLIM, E. M.; SAKIYAMA, N. S. |
|
Afiliação: |
FLÁVIA THIEBAUT ANDRADE, UFV/BIOAGRO; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; BÁRBARA HUFNAGEL MACIEL, UFV/BIOAGRO; SAMUEL MAZZINGHY ALVARENGA, UFV/BIOAGRO; EUNIZE MACIEL ZAMBOLIM, UFV; NEY SUSSUMU SAKIYAMA, UFV. |
|
Título: |
Obtenção de ESTs potencialmente relacionadas à resistência do cafeeiro à ferrugem por meio de análise in silico. |
|
Ano de publicação: |
2007 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
A partir das informações geradas no Projeto Brasileiro do Genoma Café (PBGC) foram identificadas, por meio de análise in silico, seqüências potencialmente envolvidas na resistência a Hemileia vastatrix Berk. et Br. presentes nos cafeeiros. Foram usadas diferentes estratégias para minerar as seqüências de interesse. Inicialmente, palavras-chave que correspondem a termos relacionados aos mecanismos de resistência de plantas a patógenos foram obtidas da literatura e utilizadas como ?iscas? para mineração dos dados. Com o auxílio de ferramentas disponíveis na plataforma de bioinformática do PBGC, criaram-se projetos englobando as ESTs (Expressed Sequence Tags) relacionadas a cada uma destas palavras. Outra estratégia utilizada foi a busca por similaridades entre algumas seqüências envolvidas com a resistência do cafeeiro a doenças já publicadas com as seqüências do PBGC, por meio do algoritmo BLAST. Utilizou-se, também, o ?Electronic Northern?, uma ferramenta desenvolvida pelo Laboratório de Genômica e Expressão (LGE). A mineração, usando as três estratégias, identificou 8.968 seqüências do PBGC. O envolvimento ou ligação destas seqüências com genes de resistência à ferrugem do cafeeiro será confirmado, em trabalhos futuros, utilizando marcadores moleculares e técnicas de genômica funcional. |
|
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Genômica; Mineração de dados. |
|
Thesagro: |
Café. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/46995/1/Obtencao-de-ESTs.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02097nam a2200217 a 4500
001 1906362
005 2011-11-18
008 2007 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aANDRADE, F. T.
245 $aObtenção de ESTs potencialmente relacionadas à resistência do cafeeiro à ferrugem por meio de análise in silico.$h[electronic resource]
260 $aIn: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café$c2007
520 $aA partir das informações geradas no Projeto Brasileiro do Genoma Café (PBGC) foram identificadas, por meio de análise in silico, seqüências potencialmente envolvidas na resistência a Hemileia vastatrix Berk. et Br. presentes nos cafeeiros. Foram usadas diferentes estratégias para minerar as seqüências de interesse. Inicialmente, palavras-chave que correspondem a termos relacionados aos mecanismos de resistência de plantas a patógenos foram obtidas da literatura e utilizadas como ?iscas? para mineração dos dados. Com o auxílio de ferramentas disponíveis na plataforma de bioinformática do PBGC, criaram-se projetos englobando as ESTs (Expressed Sequence Tags) relacionadas a cada uma destas palavras. Outra estratégia utilizada foi a busca por similaridades entre algumas seqüências envolvidas com a resistência do cafeeiro a doenças já publicadas com as seqüências do PBGC, por meio do algoritmo BLAST. Utilizou-se, também, o ?Electronic Northern?, uma ferramenta desenvolvida pelo Laboratório de Genômica e Expressão (LGE). A mineração, usando as três estratégias, identificou 8.968 seqüências do PBGC. O envolvimento ou ligação destas seqüências com genes de resistência à ferrugem do cafeeiro será confirmado, em trabalhos futuros, utilizando marcadores moleculares e técnicas de genômica funcional.
650 $aCafé
653 $aBioinformática
653 $aGenômica
653 $aMineração de dados
700 1 $aCAIXETA, E. T.
700 1 $aMACIEL, B. H.
700 1 $aALVARENGA, S. M.
700 1 $aZAMBOLIM, E. M.
700 1 $aSAKIYAMA, N. S.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
|
Data corrente: |
13/07/2022 |
|
Data da última atualização: |
13/07/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
|
Autoria: |
CAMILLO, J.; OLIVEIRA, M. do S. P. de. |
|
Afiliação: |
JULCÉIA CAMILLO, Plantas & Planos Consultoria; MARIA DO SOCORRO P DE OLIVEIRA, CPATU. |
|
Título: |
Espécies oleaginosas nativas da Região Norte. |
|
Ano de publicação: |
2022 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: CORADIN, L.; CAMILLO, J.; VIEIRA, I. C. G. (ed.). Espécies nativas da flora brasileira de valor econômico atual ou potencial: plantas para o futuro: região Norte. Brasília, DF: MMA, 2022. |
|
Páginas: |
p. 1121-1124. |
|
Série: |
(Série Biodiversidade, 53). |
|
Idioma: |
Português |
|
Thesagro: |
Óleo; Óleo Vegetal; Planta Oleaginosa. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1144673/1/Plantas-para-o-Futuro-Norte-1122-1125.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 00672naa a2200181 a 4500
001 2144673
005 2022-07-13
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aCAMILLO, J.
245 $aEspécies oleaginosas nativas da Região Norte.$h[electronic resource]
260 $c2022
300 $ap. 1121-1124.
490 $a(Série Biodiversidade, 53).
650 $aÓleo
650 $aÓleo Vegetal
650 $aPlanta Oleaginosa
700 1 $aOLIVEIRA, M. do S. P. de
773 $tIn: CORADIN, L.; CAMILLO, J.; VIEIRA, I. C. G. (ed.). Espécies nativas da flora brasileira de valor econômico atual ou potencial: plantas para o futuro: região Norte. Brasília, DF: MMA, 2022.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
